病原菌为侧柏绿胶杯菌(Chloroscypha platycladus sp．nov．)。子囊盘单一或聚集在枯死鳞叶或细枝表面。有短柄或无柄，黑色漏斗状，吸水后膨大呈盘状或杯状，橄榄绿色。子囊盘直径0．21～0．46mm。子实层由粘状胶质组成。子囊圆筒形到棍棒形，80～129μm×10～15μm，内含8枚子囊孢子。子囊顶端微孔，用染色剂染色无蓝色反应。侧丝丝状，透明、端部略膨大，有时有分枝，78～120μm。子囊孢子单胞，营养钵侧柏树苗，多为单列，成熟时透明，椭圆形或球形，13～18μm×8～15μm。
北方地区侧柏多采用高床或高垄育苗，在一些于旱地区也采用低床育苗。一般播种前要灌透底水，然后用手推播种磙或手工开沟条播。垄播：垄底宽60厘米，垄面宽30厘米，垄高12—15厘米，每垄可播双行或单行，双行条播播幅5厘米，单行宽幅条播播幅12～15厘米。床作播种：一般床长10—20米，床面宽1米，侧柏树苗，床高15厘米，每床纵向(顺床)条播3—5行，甘肃侧柏树苗，播幅5～10厘米，横向条播，播幅3—5厘米，行距10厘米。播种时开沟深浅要一致，小侧柏树苗批发，下种要均匀，播种后及时覆土1～1．5厘米，再进行镇压，使种子与土壤密接，以利于种子萌发。在干旱风沙地区，为利于土壤保墒，有条件时可覆土后覆草。
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